占领南澳后，联合舰队以南澳岛为基地，攻打大陆刘香的地盘，并封锁各江口。不久后，陈胜利的海防军和陆路军也赶到，海防军占领海边区域和江边区域，陆路军也占领了靖海所和海门所后，在攻打蓬州所。
十天时间不到，就发现刘香突然反攻联合舰队并突围而出。这次联合舰队没有跟踪追击，追了一程后，就返回潮汕地区肃清残敌，陈胜利等也顺势接管当地，进兵到大诚所。
联合舰队在潮汕地区用了一个多月时间，肃清潮汕地区的海盗残余后，休息的一段时间。然后，向西肃清海面，陈胜利安排好潮汕地区防务后，也随同向西而行。在广州附近休息几天后，越过澳门，继续向西而行。到了琼州海峡的琼州府宵事休息。
陈胜利也带了许多路军有备而来。在联合舰队海战的时间中，屯田军进入了锦囊所、海安所、海康所、乐民所等地，现在要进入了南海卫和廉州、钦州地区。廉州、钦州在后世是广西的地方，在明时归广东管，广西在明时没有出海口。
郑芝龙舰队在琼州休息，与琼州府的交涉自然有地方官和太监。杨普舰队则向廉州、钦州搜索前进，陆路军也乘机进入永安所、永安州等地。
一个月后，杨普回到琼州府，然后分兵搜索，郑芝龙舰队从东沿海南岛海岸搜索，杨普向西沿海南岛海岸搜索，其后，联合舰队汇合于崖州附近。问题是没有找到刘香海盗船队。
留下陆路军在海南岛后，联合舰队回到了夏门和澎湖。
海军部认为杨普舰队还没有占有优势，所以抽调船只和人员增加杨普舰队的力量，同时把刚造好的船也拨给了杨普。在上次出船后，时间又过去了半年，又有新船造好了，主要有十艘大船，二艘广船，四艘福船，四艘盖伦船。广船是两千料的船，福船则是三千料的船，盖伦船也比上次的大，能与三千料的福船相当大小。
海军的争论出了半结果，认为盖伦船迅速快善于作战，福船较平稳，运货、载人、作战都行，先用盖伦船与福船结合的战船结构。杨普得到增援后，力量接近增加一倍。
郑芝龙本以为自己缴获了部分船只，力量又增加了，但看到杨普增加了那么多船后，不竞感到失色。郑芝龙一直来都以汪直为榜样，只不过不想汪直样被杀，所以想招安。郑芝龙即想象汪直样独霸中国海，至少要独霸南中国海，又想有官方的权势和辈景，便于聚财。郑芝龙发现了杨普舰队的实力后，军阀思想有所收敛。