一众高层打消了疑虑，就介入巴拉圭的问题达成了共识，接着，巴西共和国的军事机器便迅速开动了起来。
与汉国交界的两万巴拉那州驻军不动，里约热内卢、圣保罗、坎皮纳斯等地的驻军，按照共和政府的命令，向着乌贝拉巴、圣若泽两地开进、集结，准备采取保守的作战策略，优先进攻戈南马托格罗索州和亚斯州南部地区。
1889年6月10日，第一批4000人的巴西共和国陆军抵达圣若泽，1889年6月17日，乌贝拉巴驻军人数增长至1.1万人，1889年6月20日，聚集在靠近南马托格罗索州和戈亚斯州南部地区的巴西共和国军队总数达到3.2万人。就在巴西共和国紧张向边境地区调动兵力的时候，决定巴拉圭政权归属的大战，也缓缓拉开序幕。
半个多月前，1889年6月3日，经过一周时间整顿、修整，近卫骑兵营营长曼利伊利、巴拉圭陆军第二旅旅长沃什伯恩、巴拉圭陆军第三师师长西尔维斯特雷三人在康塞普西翁正式宣告誓师出征，南下扫除四人摄政委员的叛逆武装。
当天中午，誓师仪式结束，三人留下1500士兵防守康塞普西翁，然后带领剩下约1万名士兵，搭乘最近搜罗到的40余艘大小船只，顺流而下向亚松森方向发动进攻。
6月4日傍晚，讨逆联军行进至巴拉圭河中下游水域，驻守在伊瓦波沃港的300余名港口守备部队不战而降，携带着武器、船只加入了讨逆联军的行列。
6月6日，进军途中，依次接纳、整编了数支问询赶来的地方驻军小部队，讨逆联军的数量增加至1.12万人。
6月8日，讨逆联军在巴拉圭河沿岸的圣佩德罗小镇短暂修整一晚，接着，第二早上，汇集了更多运输船只、士兵的船队按照作战计划，继续向南进发。
6月8日中午，为了迟滞讨逆联军费推进速度、为固守亚松森争取更多的时间，四人摄政委员会签署调兵法令，命令近卫军、第一步兵旅各抽调一部分兵力，联同亚松森政府招募的1000青壮一块出发，赶赴讨逆联军进军路线上的安特克拉港和亚松森北部郊区的林奇奥镇驻守抵抗，然后在完成迟滞任务之后，幸存部队分做两路，一路由近卫军少校布坎兰带领，返回亚松森，另一路由第一旅第三营营长波尔克带领，转走陆路绕到讨逆联军背后，以分散出击的方式，对讨逆联军的后勤补给路线，进行袭扰和破坏。
调兵命令发布一天后，1889年6月9日下午，总计1800名，由近卫军一部、第一旅第三营和1000名临时招募的士兵组成的增援部队，分别抵达林奇奥镇和安特克拉港。
林奇奥镇和安特克拉港两地，一个扼守着亚松森的北大门，一个是巴拉圭下游地区的军事要地，二者地理位置非常重要，21年前，第一次巴拉圭战争期间，小洛佩斯带领的巴拉圭部队和巴西、阿根廷组成的联军，曾经在两地进行了一场长达11个月的拉锯战。
21年前发生的那场战争，以巴拉圭的惨胜告终，但是21年之后，当战斗的两方换成了讨逆联军和四人摄政委员之后，战争的激烈程度大大降低。
6月10中午，讨逆联军一部抵达安特克拉港，随即向港口驻军发动试探性进攻。
6月12日，讨逆联军投入3000名士兵，加入对安特克拉港的围攻战。
6月15日上午9时，港口驻军一部发哗变，临近港口西部的高地出现防御缺口，
上午11时，200余名讨逆联军士兵沿着缺口进入港口内线防御阵地，安特克拉港口防御体系出现崩溃征兆。
下午13时，涌进港口内线防御阵地的讨逆联军士兵数量超过1000人，港口核心要塞面临被四面包围的危机。
下午14时，第一旅第三营营长带领残余的200余名士兵擅自撤离，近卫军所部防御侧翼暴露。
下午16时，安特克拉港石堡要塞升起白旗，近卫军少校布坎兰和港口驻军指挥官带领约800名士兵走出石堡，宣布投降。
安特克拉港战役持续六天，驻守港口的1400余名士兵，除去逃散的300余人，剩下1100名士兵中，战死或负伤者约300人，投降并被强制性打散、补充进讨逆联军者约800人。
安特克拉战役结束后的第四天，讨逆联军主力抵达林奇奥镇。
林奇奥镇原本驻扎有400名正规军和200名二线民兵，安特克拉港失陷后，四人摄政委员会在第一批增援部队的基础上，又向林奇奥镇派遣了500名正规军。
接受两次增援过后，林奇奥镇的防守兵力达到了2000人，不过，其中真正有战斗力的部队，只有1200余人，剩下约800名临时征调的兵员，要么是岁数只有十一二岁的娃娃兵，要么是年龄超过四十五岁的老爷兵，这些兵员充斥在阵地中，除了能够在士兵数量上显得充实一点，真正能够在战场上发挥的作用，却十分有限。
适龄男子缺乏的现象在巴拉圭各方势力中都有体现，不过与四人摄政委员会掌控的武装力量相比，因为拥有超过对方两倍的正规兵力，讨逆联军面临的情况，要比四人摄政委员一方好了许多。
6月21日，林奇奥争夺战打响，开战伊始，讨逆联军便投入了野战山炮、炮艇舰炮、加特林手摇机枪等重型武器掩护步兵发动进攻。
6月23日，战斗持续的第三个晚上，守军部队放弃了小镇内外的阵地，仅仅携带着随身的步枪，向亚松森方向逃窜。
6月24日，沿着林奇奥溃兵逃窜的路线，600余名讨逆联军士兵进入亚松森近郊地区。
6月26日，再次留下少量兵力维持后方物资补给路线秩序后，总兵力依旧达到一万人的讨逆联军主力抵达了亚松森西部的阿耶斯港区域。
6月27日，4000名讨逆联军士兵分别从林奇奥和西部阿耶斯港方向，对亚松森发动全面攻势。
6月28日，讨逆联军接连攻破四人摄政委员会设立在城外的两道外围防线，逼近至亚松森城区核心区域。
6月30日，讨逆联军抽调向西部战线方向派遣了3000增援部队，战场上，讨逆联军方面的一线战斗人员达到了近7000人。
7月1日，四人摄政委员会部署在城外的最后一道防御阵地失陷，讨逆联军的前沿部队推进至距离亚松森皇宫只有8公里的位置。
7月3日，四人摄政委员会达成一致意见，决定由海军舰队（实际上是内河舰队）承担反击任务，从巴拉圭下游地区北上航行，对讨逆联军进行海上打击。
7月4日下午14时，当讨逆联军主力集结于亚松森城下，正在对亚松森守军进行新一轮进攻时，由法尔康少将指挥的海军舰队突然逆行至亚松森西部的阿耶斯港。
巴拉圭水上力量主要掌控在四人摄政委员会手中，阿耶斯港的炮台和沿河防御要塞也在早前的战争中，毁损过半，因此，突然遭遇四人摄政委员会水上力量打击的讨逆联军一方，根本没有能力组织起有力反击。
下午18时，发生在阿耶斯港的水上作战持续了4个小时，讨逆联军停靠在附近港口、河道的运输船队损失量超过一半，弹药物资损失量超过三分之二。
下午19时，当法尔康少将指挥的海军舰队撤离半个小时后，部分配属大型火炮的部队才赶到战场。
原本便不占优势的水上力量损失过半，阿耶斯港战斗过后，讨逆联军与四人摄政委员会掌握的水上力量对比失衡被进一步拉大，